Hết thời hạn quyết toán doanh nghiệp mới bị từ chối tờ khai thuế thì có bị phạt không?

Doanh nghiệp có bị phạt trong trường hợp hết hạn quyết toán thuế, cơ quan thuế mới thông báo không chấp nhận tờ khai thuế không? 

Tại Hội nghị đối thoại với các doanh nghiệp nhỏ và vừa trên địa bàn TP Hà Nội năm 2026, đại diện cơ quan thuế đã trả lời các câu hỏi liên quan đến lĩnh vực thuế và kê khai thuế 2026. Trong đó, Công ty TNHH Một thành viên Mỹ Phục nêu: Trong quá trình nộp quyết toán thuế thu nhập cá nhân, khi hết thời hạn quyết toán cơ quan thuế mới thông báo bằng mail là không chấp nhận tờ khai thuế của doanh nghiệp thì doanh nghiệp có bị tính phạt chậm nộp tờ khai không?

Ngày ghi nhận nghĩa vụ nộp hồ sơ khai thuế là ngày thông báo tiếp nhận tờ khai thuế lần đầu

Trả lời câu hỏi của Công ty TNHH MTV Mỹ Phục về thời hạn nộp quyết toán thuế, cho biết đây là câu hỏi mang tính chuyên ngành, đồng chí Vũ Mạnh Cường, Trưởng Thuế Hà Nội cho biết: trường hợp không chấp nhận hồ sơ khai thuế thì cơ quan thuế sẽ gửi thông báo không chấp nhận và nêu rõ lý do. Người nộp thuế thực hiện điều chỉnh hồ sơ khai thuế và gửi lại, thì ngày ghi nhận nghĩa vụ nộp hồ sơ khai thuế là ngày thông báo tiếp nhận hồ sơ khai thuế điện tử lần đầu của hồ sơ. 

Cơ quan thuế thông báo không chấp nhận tờ khai thuế, người nộp thuế không nộp lại thì tính là chưa nộp hồ sơ khai thuế

Trường hợp cơ quan thuế có thông báo không chấp nhận hồ sơ và người nộp thuế không nộp lại hồ sơ khai thuế hoặc nộp lại hồ sơ khai thuế nhưng vẫn không được chấp nhận thì được xác định là chưa nộp hồ sơ khai thuế. 

Đồng chí Vũ Mạnh Cường lưu ý, hiện nay, trên Cổng thông tin điện tử của ngành thuế đã được cải tiến rất lớn. Việc gửi thông báo tiếp nhận hồ sơ khai thuế điện tử cho người nộp thuế được thực hiện chậm nhất là sau 15 phút kể từ khi nhận được hồ sơ. 

Đồng thời, chậm nhất một ngày làm việc kể từ ngày ghi trên thông báo tiếp nhận hồ sơ khai thuế điện tử thì cơ quan thuế sẽ gửi thông báo chấp nhận hay không chấp nhận hồ sơ khai thuế điện tử cho người nộp thuế. 

Do đó, đề nghị doanh nghiệp nên theo dõi cái mốc thời gian trên để rà soát hồ sơ khai thuế đã nộp thành công hay chưa, tránh tình trạng nộp chậm, nộp muộn hồ sơ./.